انطلق برنامج هندسة الأتمتة الصناعية في عام 1994م كثاني تخصص في دائرة الهندسة الكهربائية. وتركزت أهدافه على توفير الكوادر الهندسية اللازمة لدعم الصناعة في فلسطين وإعداد المهندسين لتصميم وتشغيل وتطوير أنظمة التحكم والأنظمة الصناعية باستخدام أحدث تقنيات التحكم الآلي التقليدي والمحوسب. تمتد الدراسة في هذا البرنامج لمدة خمس سنوات بواقع 160 ساعة معتمدة.

يهدف هذا البرنامج إلى تخريج مهندسين يكون بمقدرتهم التحكم بأنظمة القيادة الكهربائية الآلية المختلفة بواسطة الكمبيوتر عن طريق برمجة دوائر التحكم المختلفة لهذه الأنظمة باستخدام لغات خاصة بذلك.

1. بناء الماكينات الصناعية
2.  برمجة انظمة التحكم
3. مهارات صيانة المعدات الكهربائية والصناعية
4. مهارات تدريب مهني
5. مهارات سكادا وتحكم مبرمج

1. المصانع الغذائية.
2. مصانع  البتروكيماويات. 
3. الخطوط الإنتاجية بكافة أنواعها.
4. ورش تصنيع الحجر والرخام. 
5. المصاعد والأدراج الكهربائية. 
6. مساعد بحث وتدريس في الجامعات و المعاهد التقنية  والمؤسسات الأكاديمية. 
7. أشراف هندسي في المكاتب والمقاولات الهندسية.  
8. التجارة الهندسية: مهندس مبيعات تقنية.