يسعى برنامج الدكتوراه في إدارة الأعمال الى بناء كادر متخصص في ادارة الاعمال، قادر على قيادة وتطوير المؤسسات ورسم السياسات، حل مشاكل المجتمعية وإثراء البحث العلمي  في مجال إدارة الأعمال.

برنامج الدكتوراه في هندسة تكنولوجيا المعلومات (PhD in Information Technology Engineering) هو برنامج مشترك بين جامعة بوليتكنك فلسطين، جامعة القدس، والجامعة العربية الامريكية. يركز البرنامج على تطبيق المنهجيات الهندسية في مجالات تكنولوجيا المعلومات المختلفة، هذا بالإضافة الى مفاهيم الأنظمة المحوسبة المختلفة في مجالات البحوث المتعددة لخدمة ودعم التخصصات المختلفة (Interdisciplinary).